Πένες με κιμά και μπεσαμέλ στον φούρνο

Υλικά 300 γρ. μακαρόνια 1 μεγάλο κρεμμύδι 400 γρ. ψιλοκομμένες ντομάτες κονσέρβα 1 κ.σ. ζάχαρη 3 κ.σ. λάδι Θυμάρι Βασιλικό Αλάτι Πιπέρι Για την μπεσαμέλ 70 γρ. βούτυρο 4 κ.σ. αλεύρι 800 ml. Γάλα 2 αυγά Αλάτι Πιπέρι άσπρο τριμμένο Μοσχοκάρυδο κατά προτίμηση 200 γρ. σκληρό τυρί ενταμ ή άλλο